L’atout majeur de Rodrigues est sans nul doute sa barrière récifale. Pas moins de 270 espèces de coraux ont été recensées, dont certaines assez insolites, avec des teintes fluos. Plus étrange encore, un corail qui passe du marron au blanc quand on le frôle… L’absence d’usine et la faible fréquentation des plongeurs a donc permis de garder intacts des massifs coralliens de toute beauté. Sur ces constructions naturelles évoluent mérous, poissons papillons, chirurgiens, poissons trompettes, balistes, diodons et autres représentants de la faune colorée.
Sur certains sites, ce sont les carangues qui attirent les plongeurs, notamment dans la passe Saint-François où un énorme banc est quasiment toujours au rendez-vous. Des tortues sont également présentes. Les requins croisent au large mais ne s’approchent généralement pas assez pour être aperçus des plongeurs.